mmcci.CCIData
=============

.. currentmodule:: mmcci

.. autoclass:: CCIData

   
   .. automethod:: __init__

   
   .. rubric:: Methods

   .. autosummary::
   
      ~CCIData.__init__
      ~CCIData.calc_overall
      ~CCIData.copy
      ~CCIData.create_pathway_assay
      ~CCIData.filter_by_p_vals
      ~CCIData.get_adata
      ~CCIData.get_cell_types
      ~CCIData.get_lr_proportions
      ~CCIData.get_p_vals
      ~CCIData.get_sample_cci_scores
      ~CCIData.get_sample_metadata
      ~CCIData.get_sample_n_spots
      ~CCIData.get_sample_p_values
      ~CCIData.merge_cell_types
      ~CCIData.rename_cell_types
      ~CCIData.save
      ~CCIData.scale
      ~CCIData.scale_by_nspots
      ~CCIData.subset_lrs
      ~CCIData.to_dict